האם ניתן לרשום פטנט על תוכנה? התשובה היא, כן ניתן לרשום פטנט על תוכנה, אך נושא זה היה ועדיין נושא מורכב וישנם חילוקי דעות לגביו. כבר בתחילת שנות השמונים נקבע בפסק דין כי ניתן לרשום פטנט על תוכנה. בשנות ה-90, חלה התגמשות נוספת במדיניות רישום הפטנטים על תוכנות. בשלהי 1998 נפרץ מחסום משמעותי על ידי ארה"ב. בית המשפט הסמכותי (Federal Circuit) קבע הלכה תקדימית ביחס לפטנט על תוכנה. וככל שהזמן עובר ארה"ב מתקדמת בנושא זה של פטנט על התוכנה. המצב באירופה - אפשר לומר שהמצב באירופה איננו מגובש וברור כמו בארה"ב, אבל קרוב לודאי שבהצגה מתאימה אפשר לשכנע את לשכת הפטנטים האירופאית להעניק פטנט על כל אמצאה שעליה לשכת פטנטים של ארה"ב הייתה מעניקה פטנט. המצב בישראל - בחוק הישראלי אין שום הוראה לגבי תוכנות או דבר כלשהו המתייחס למחשבים. זאת אומרת, שכדי לסרב להעניק פטנט על תוכנה, רשם הפטנטים יהיה חייב לקבוע שהתוכנה או תוכנות המחשבים בכלל, אינן מוצר או תהליך. אפשר לומר שבישראל מתן הפטנטים על תוכנות עדיין פתוח, וקרוב לודאי ההכרעה הסופית תושפע ע"י ההחלטות המתקבלות בארצות אחרות.

היתרון העצום בהגנה על תוכנת מחשב באמצעות פטנטים הוא בחוזק הזכויות הניתנות ע"י חוק הפטנטים. בעלים של פטנט רשום יוכלו, למשל, למנוע מאחרים לשווק תוכנת מחשב אשר מבצעת פעולה באופן מסוים (לדוגמה שליטה בתהליך ייצור). בפועל ישנו מצב של חוסר בהירות לגבי השאלה אלו תוכנות ניתן לרשם כפטנט ואלו לא. חוסר בהירות זה נובע ברובו מהעובדה כי פסקי הדין העוסקים בסוגיה של רישום פטנטים על המצאות מבוססות תוכנה, אינם מעניקים את הכלים או יוצרים חוקים בהירים שיאפשרו לעורכי פטנטים להגיע לקביעה מושכלת, אילו מהתוכנות, אם בכלל, תרשמנה כפטנט. בפועל, למרות הדרישות המשפטיות המחמירות, אשר אמורות למנוע במרבית המקרים רישום פטנט על תוכנה, פטנט מבוסס תוכנה נרשם לעתים קרובות, בעיקר בגלל חוסר בהירות במצב המשפטי הקיים.

הקטעים לעיל לקוחים ממאמר שמופיע במלואו ב wiki book
למאמר נוסף בנושא פטנט על תוכנה
לרישום פטנט